清华大学附属北京清华长庚医院一期于2014年11月28日正式运营，八年的时间里医疗、教学、科研快速协同发展，现代医院管理制度体系和治理体系发挥效能，初步建成综合实力雄厚、专科阵容强大、名医名家汇聚、医院治理良善、医疗品质一流，在业界和社会享有美誉的综合性精品医院，已为713万余人次患者提供了优质、高效、经济、可及的门急住诊服务，开展国内外领先的医疗技术百余项，创下多项世界记录，以先进技术和优质服务成功救治了大批来自海内外的复杂危重病患，连续四年位列国家卫健委三级综合公立医院考核A+。三年来，医院还坚持疫情防控与医院发展两手抓的原则，派出万余人次支援武汉、河北以及北京地坛佑安小汤山等市属医院，支援流调、深入社区开展核酸采样与疫苗接种。
医院二期工程项目作为北京市“回天计划”的重点工程项目之一《网易云彩票》，由北京市政府出资建设，建筑设计由全球医院设计水平排名第一的美国HDR领衔，建筑施工由中国建筑一局(集团)有限公司总承包，总建筑面积15.6万平米，建成后将新增床位500张，日均接诊能力可增加600
医院二期工程将重点建设“妇儿中心”，增加京北地区妇产科和儿科的优质医疗服务资源。同时，打造京北地区急重症救治中心，重点涵盖创伤、心脑卒中、危重孕产妇和婴幼儿救治工作。
借助京津冀协同发展战略和清华大学双一流大学建设，清华长庚医院将以二期工程建设为支撑，全面提升医院整体医疗服务效能，重点打造具有医疗技术优势和创新引领能力的肝胆胰中心、器官移植中心、消化中心、神经中心、心脏中心、肿瘤中心等优势学科，成为辐射京津冀乃至全国患者的国家医学中心。
